三个月婴儿咳嗽治疗有效的办法需要根据具体病情而定。如果是上呼吸道感染而导致的咳嗽，大部分是由于病毒感染，就可以在医师指导下服用止咳药物进行对症的治疗，但是需要注意观察有无痰液存在，如果有就不能强力的进行止咳，同时还需要注意观察口唇有无发绀等情况存在，以防发生痰液堵塞窒息。如果考虑细菌感染导致的咳嗽，就需要根据具体病情选择有效的抗生素进行治疗，需要注意尽量多休息。