双歧杆菌三联活菌胶囊主要用于治疗因肠道菌群失调引起的急慢性腹泻、便秘。也可用于治疗轻中型急性腹泻、慢性腹泻及消化不良、腹胀以及辅助治疗肠道菌群失调引起的内毒素血症。该药是口服药物，一般每次两到四粒；每日两次，重症患者加倍。在饭后半小时用温水服用。儿童用量应根据体重病情酌减，婴幼儿服用时，可将胶囊里的药粉置于温开水或温牛奶中进行冲服。