卵巢囊肿可以通过以下几个方面分辨是良性还是恶性。第一，通过穹窿穿刺抽检腹水的手段做细胞学的检查，尤其是针对恶性肿瘤的判断准确率高达91%。第二，腹腔镜，通过腹腔镜能清楚的看到肿瘤的体积，并且在可以的部位做活检，也可以做术后的监护，对于永久性的腹膜肿瘤，可以做直接的观测。第三，做钡剂灌肠，此项主要是检测较大的卵巢肿瘤与结核性的腹膜炎，可以直面胃肠道全部的情况。第四，通过B超检查，看囊肿的形态、大小，去初步判断其良恶性。第五，再通过CT扫描或者核磁共振扫描以及进一步的增强扫描，可以进一步看清楚囊肿的形态以及强化的情况去分析判断其良恶性。