子宫内膜异位症的原因目前还没有完全查明，目前关于子宫内膜异位症的发病原因有三种学说。第一个是种植学说，这是1921年的一个科学家提出来的，也是目前公认最为重要的学说。这一个学说认为，子宫内膜异位的内膜是来源于子宫内膜组织，这些组织转移到宫腔以外的部位，并且种植和生长。第二个学说是体腔上皮化生学说，认为异位的内膜细胞是来源于盆腔腹膜的体腔上皮化生。第三个学说是诱导学说，诱导学说认为种植的内膜释放某种未知的物质，诱导未分化的间充质，形成子宫内膜异位组织。