根据中国铁路客户服务中心的规定，所有乘客在购买火车票时都需要提供真实有效的身份证明，同时系统会自动记录乘客的行程信息。因此，如果火车路过疫区，乘客的行程记录会被记录在系统中。

此外，中国铁路客户服务中心还要求所有乘客在车站进站前需要进行体温检测，并且乘客需要在车站或者列车上配合工作人员进行健康申报。这些信息也会被记录在系统中，以便于疫情防控部门进行跟踪和管理。

综上所述，火车路过疫区时会记录乘客的行程信息，以及健康状态等信息。这些信息可以帮助疫情防控部门及时掌握疫情动态，及时采取措施保障公众健康安全。