尖锐湿疣可以用的药膏有5%的米奎莫特霜，该药可以通过诱导局部细胞因子的产生，调节局部炎症反应，达到抗病毒的作用，每周外用三次，连续使用16周，每次用药6到10小时后洗去，该药的特点是局部反应轻，疗效好，复发率低，可以由患者自己使用。其他药物如5%的肽丁安擦剂，每日1到2次涂于患处，还有干扰素凝胶或干扰素软膏，每日四次，连涂2到3个月，五氟尿嘧啶软膏也有抑制DNA和RNA和合成，以免疫刺激作用，每日外用1到2次，但孕妇忌用。其他的药物如50%的三氯醋酸溶液，也可以涂在疣体上，但是要注意保护周围正常的皮肤和黏膜。