双肾萎缩，说明有各种各样的肾脏疾病，比如慢性肾小球肾炎、间质性肾炎或者由于高血压导致肾脏萎缩，如果病因是可以治疗的，比如高血压或者慢性肾小球肾炎要针对病因进行治疗，即控制血压、激素和免疫抑制剂药对蛋白尿。除了针对病因治疗外，出现双肾萎缩的病人一般都已经进入到肾功能不全的失代偿期，针对肾功能不全采用非透析疗法，包括低蛋白饮食、α-酮酸来延缓肾功能的进展。如果血肌酐升高，出现恶心、呕吐等症状，还要纠正酸中毒以及排毒来治疗。如果进入尿毒症期，需要进行肾脏替代治疗，因此双肾萎缩治不好，只能控制疾病的进展。