婴儿肠炎吃什么药物最好需要根据具体病情而定。如果是病毒感染导致的主要是服用肠道益生菌进行肠道功能的调节以及多喝口服补液盐，补充水分电解质，必要时服用肠道粘膜保护剂减轻腹泻的症状，比如：蒙脱石散等，注意观察大便的性状，次数以及有无黏液、血液等，必要时进行大便常规的检查，如果存在细菌感染建议及时进行有效的抗感染治疗，注意观察精神状态以及小便量的情况，避免出现严重的循环障碍。