肛瘘一旦形成应尽早手术。由于肛瘘病情拖延，炎症就会逐渐蔓延，组织被腐蚀，腐烂面积任意增大，不仅可以派生之管，还可以向深部组织侵犯，特别是蔓延于肛门括约肌，肛管直肠环上形成更复杂的肛瘘，给治疗带来很大的难度。肛瘘固然可以暂时闭合，但这是假象。管道内仍残留未彻底消灭的细菌和坏死组织等。假如抵抗力下降或碰到一定的诱因，比如吃辛辣刺激的食物，或者受凉，局部的炎症就可能再次复发。再一次导致肛瘘的复发，肛瘘长期反复流脓不愈，一定会影响直肠与肛门的正常功能，进而影响健康正常的生活，加上肛瘘伴有的疼痛让患者也长期备受折磨，造成严重的心理负担。所以说肛瘘要完全愈合，必须依靠手术治疗，且越早越好。