肾脓肿，它的病因是由于病原微生物通过血液播散，定植到肾脏，然后形成感染灶。常见的病原菌一般是革兰氏阳性球菌，例如金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌，粪肠或者屎肠球菌。具体其他病原的来源未知，但是途径就是通过血液播散，然后患者往往有一些基础性抵抗力减弱，例如糖尿病血糖控制不好，或者是泌尿系存在梗阻，例如肾结石、输尿管结石、狭窄等等。而肥胖也是这一类患者的一个高危因素。