甲钴胺有一定的副作用，但总体而言甲钴胺的副作用并不大。甲钴胺最常见的副作用就是对肝肾功能的损伤。甲钴胺进入机体以后需要经过肝肾代谢，如果连续服用甲钴胺的时间超过15天，需要进行肝肾功能的检测，排除损伤肝肾功能的可能性。长期服用甲钴胺除了会引起肝肾损伤外，还可能会导致胃肠道的不良反应主要表现为恶心、呕吐、腹泻等。甲钴胺虽然有副作用，但是甲钴胺的这些副作用在临床中比较少见，而且甲钴胺的副作用也比较小。