咽喉炎长期咳嗽，有可能是感染的原因造成，这种情况需要查明病原体，并且针对病原体应用药物进行治疗，细菌性的感染，选择应用敏感的抗生素，病毒性的感染应用抑制病毒合成酶的药物，或者抑制病毒蛋白质合成的药物进行治疗。如果是属于过敏性的原因造成的，可以查明过敏原，并且脱离或者避免接触过敏原应用抗过敏的药物进行治疗。如是理化刺激的原因造成，可以避免理化刺激治疗。