怀孕后雌二醇低的原因比较多，具体如下：1、胚胎发育不良，如果胚胎的质量差或者胚胎停育，都容易造成雌二醇下降或者雌二醇的数值偏低。需要进一步的产检，确诊是否有必要保胎。2、先兆流产。孕早期有先兆流产的迹象，也容易出现雌二醇低的现象，需要根据产检的结果补充天然的雌激素保胎。3、卵巢早衰。孕妇自身有卵巢早衰的现象，也容易造成孕早期雌二醇低。4、外界因素影响。孕妇精神压力大、休息不好或者外界环境的刺激，都容易对雌二醇造成影响。