肛瘘是一种慢性炎症性疾病，当其处于发作期时，可以引起脓性分泌物自外溃口溢出。当由于肛腺分泌量增加，阻塞或者受到细菌感染时，会导致肛周软组织的急性炎症，从而形成肛周脓肿。如果肛周脓肿治疗不及时或者不规范，急性炎症会逐渐转为慢性炎症，从而形成肛瘘，自此迁延不愈，反复引起肛周疼痛、破溃、流液。当抵抗力强而肛门卫生好时，肛瘘常处于静止期，此时仅有肛门肿物症状，无明显的疼痛感。当进食辛辣刺激性的食物过多，肛门卫生差或者抵抗力下降时，肛腺会感染引起化脓性炎症产生脓液，脓液自皮下瘘管运输到外溃口溢出。