要想治疗肛门肿胀疼痛，首先需要明确是什么疾病导致的肛门肿胀疼痛，常见的原因为肛门感染性疾病和痔疮疾病。如确诊为肛门感染性疾病所致的，可行消炎及对症治疗，如果经消炎治疗，病情没有有效的缓解，且并发脓肿的形成，则需立即采取手术切开引流。如确认为痔疮疾病导致的，多为痔核脱出不能还纳的情况发生，可行外用痔疮膏和栓剂、手法还纳治疗，如经保守治疗后病情无好转，则应考虑手术治疗，再有一种情况是大便干硬导致的排便困难而引起的肛门口肿胀疼痛症状，可以灌肠治疗。