小儿柴桂退热颗粒上市后的不良反应报告显示，此药在医生的指导下辨证合理使用，比较安全，不良反应较少，个别患者服药后可出现轻度的腹泻、腹胀、恶心等胃肠道反应。一般症状较为轻微，停药后症状会自然消失，饭后服药有助于减轻或者改善这些症状，因此出现胃肠道反应的患者可以饭后服药。另外，还有极少数患者服药后会出现皮疹、瘙痒等过敏反应，对此药过敏者禁用，过量或者长期服用会增加不良反应的发生频率和程度，因此不可擅自更改用药的剂量和疗程，如正在使用其他药品，为防止药物相互作用影响治疗，请就诊时告知医生用药史。