如果出现肛瘘复发，应当及时的前往肛肠科就诊，通过CT或磁共振检查可以了解瘘管病变走向以及与周围组织的相互关系。肛瘘复发以后应当行手术治疗，通过手术将感染源，也就是内口完整切除，将瘘管切开或切除，达到彻底根治的效果。根据瘘管位置的高低选择不同的手术方式，肛瘘复发以后手术操作相对比较复杂，如果瘘管位置比较低，可以行瘘管切除术，如果位置比较高，可以切开引流，手术的关键在于避免损伤过多的肛门括约肌，防止出现肛门失禁，同时手术后还应当注意切口的护理。