经支气管镜腔内冷冻治疗是利用超低温度作用于病变组织使细胞和组织结晶，细胞膜蛋白变性，抑制小血管管腔内血栓形成，从而使病变组织坏死以达到去除病变组织的目的。与利用热量相反，该疗法是利用重复循环的冷冻解冻来损毁组织，治疗之后效果不会立即显现，通过几天之后会出现细胞的变性、坏死、肿瘤组织缩小。