引起精神疾病的原因大致有遗传因素、社会心理因素、神经生化递质的改变、环境因素、中枢的炎症和损伤这些因素。比如精神分裂症、抑郁症、双相情感障碍，往往遗传的比例比较高。一级亲属的患病率比普通人群要高数倍，血缘关系越近发病率越高。中枢神经递质功能发生变化，比如去甲肾上腺素、五羟色胺、多巴胺在不同的精神疾病中，其功能活动是不一样。如精神分裂症常见的是多巴胺功能亢进，抑郁症是五羟色胺、去甲肾上腺素功能活动下降。目前的抗精神病药，抗抑郁的药都是作用在这些受体而起到调节神经递质的功能，达到治疗精神症状的目的。有一些疾病和中枢炎症、中枢的损伤有关系。有一些中枢部位的病变，可以出现类似的精神病症状。影像学研究也发现，精神疾病会有脑萎缩、脑血流变化。还有心理社会因素也参与某一些疾病的发病过程，如应激相关障碍、分离转换障碍以及神经症的发病过程。精神疾病的发病应该是多种因素相互作用的结果。