射精肾疼通常为肾虚合并精囊炎引起，在确诊后应当及时进行抗感染治疗，比如左氧氟沙星、阿奇霉素等。可配合补肾中成药进行调理，比如六味地黄丸、大补丸等。在治疗过程中，男性应禁止性生活，多休息，合理膳食，适当锻炼。通过一到二个月的调理可逐渐恢复正常。