精神疾病是由生物学因素，包括遗传、神经发育、感染；还有心理社会因素，包括应激、个性的人格特征等多因素引起。有很多精神疾病，都是多基因的遗传，有明显的家族聚集倾向，遗传度比较高。精神疾病可以存在脑结构和功能的可塑性改变，包括额叶、颞叶、海马的黑质或白质减少、体积缩小。临床共同的特征表现是发育的迟滞、认知功能的损害。精神分裂症、多动症、孤独症可能是一个疾病谱，与神经发育异常有关系。感染性的疾病像神经性梅毒，表现为神经系统退行性的改变、精神病性的症状、麻痹；HIV病毒感染，能够导致认知行为的损害、记忆丧失、记忆损害、注意力不集中、情绪的淡漠，随着病情的加重，可以出现缄默症、大小便失禁。分离转换障碍以及应激相关障碍，与生活事件有明显关系，另外还有很多中枢神经递质参与疾病的发病过程。