龟头有小疙瘩常见的原因如下：一、尖锐湿疣，尖锐湿疣属于性传播疾病，一般在发病前有不洁性生活史，主要表现为龟头有散在的丘疹、丘疹形态不规则呈菜花状、患者龟头会感觉瘙痒不适或者烧灼感。此时需要及时就诊确定是否为尖锐湿疣，如果是尖锐湿疣则需要及时规范的治疗。二、真菌感染龟头引起的龟头炎，此时一般需要使用抗真菌药物治疗，同时保持龟头的清洁干燥。