男性生殖器流脓主要有以下几种可能：1、淋球菌性尿道炎即淋病，属于性传播疾病，常有不洁性接触史，尿道口有脓稠的脓液流出，可伴有尿频、尿痛等尿路刺激表现，分泌物涂片可找到革兰氏阴性双球菌。2、非淋菌性尿道炎，也是广义上的性传播疾病，常由支原体、衣原体感染所致，尿道口可见较稀薄的脓液，尿路刺激症状较淋病轻。3、细菌性尿道炎，同样可以具有尿频、尿急、尿痛等尿路刺激症状，脓液量不多，行分泌物培养可以确诊。