男的小便时候尿道刺痛主要是泌尿系统感染所引起，比如前列腺炎、尿道炎、膀胱炎等，都可使男性在小便时出现尿道刺痛。男性患者应尽早去医院的泌尿外科进行血常规、前列腺液培养、尿液培养等检测。如果确为感染因素所引起，应当使用抗生素类药物进行治疗。比如头孢拉定胶囊、左氧氟沙星胶囊。治疗周期为两周左右。在治疗期间，每天应大量饮水，有利于炎性代谢物的排出，促进疾病的康复。