肛瘘最主要的治疗方法是选择手术。因为肛瘘属于肛周的一种感染性疾病，通常会表现为肛周的瘘口或者是瘘管，以及有排便带血的症状。对于表浅的肛瘘可以进行瘘管的切开、切除缝合。高位肛瘘需要进行切开挂线疗法，并且手术以后，每天需要进行换药、配合、抗感染治疗、间断坐浴。