CT检查对于全身各个系统所有器质性的疾病都是可以检查的，尤其对于密度差异大的脏器检查效果会更好。在头颅检查中，对肿瘤、出血以及梗塞检查的效果较好。胸部检查可以观察肺部的炎症、结核、肿瘤等。腹部实质脏器如肝脏、脾脏、胰腺、双肾、前列腺等，也能够很好的观察。对于乳腺、甲状腺等部位的肿块，可以清晰显示，并且做出诊断。此外，增强CT的检查对于血管的显示，也可以观察血管是否有畸形、栓塞、夹层、动脉瘤等。对于骨关节系统CT可以检查骨折、骨的肿瘤以及椎间盘突出等。