小儿灰指甲如果不是太严重，可先不予进行治疗。注意指甲部位的卫生，避免磕碰，小儿年龄逐渐增大后再进行治疗。如果比较严重，可以使用外涂的药物进行治疗，比如阿莫罗芬，在涂抹之前应当先将病甲磨薄，在涂抹后使用纱布将之包裹，还可配合使用一些口服药物进行治疗，比如氟康唑、特比萘芬等。但一定要注意在医生的指导下合理用药，不可自行随意给小儿用药，避免引起一些严重的副作用。灰指甲的治疗周期通常比较长，可能需要半年到一年左右才能够治愈。因此，在治疗期间一定要注意局部的卫生，定期消毒。