上呼吸机的治疗指证主要是一个存在呼吸困难，由于呼吸停止或者通气不足引起的急性缺氧和二氧化碳气体储留引起的交换障碍，其次，由于肺内巨大分流所引起的严重低氧血症，外来供氧无法达到足够的吸入氧囊度，此时需要上呼吸机。在重大外科手术之后如心胸上腹部手术，为预防术后呼吸功能紊乱，需进行短暂的预防性的呼吸支持，在某些神经肌肉疾病种由于肺活量受限，无法产生有效的自主呼吸，而应用机械通气，增加通气，以上需上呼吸机的情况均属于重症病情，需要密切观察相关呼吸指标。