恩替卡韦的疗程需要根据不同情况而定，对于e抗原阳性慢性乙肝患者，也就是我们所说的大三阳患者，建议治疗至乙肝DNA低于检测下限，谷丙转氨酶恢复正常，且大三阳转换为小三阳，也就是e抗原消失，且出现e抗体之后，再巩固治疗至少三年，这期间每半年复查一次，仍保持不变可考虑停药，延长疗程可减少复发。e抗原阴性慢性乙肝患者，也就是治疗前不是大三阳的患者，建议治疗至乙肝表面抗原消失，且乙肝DNA检测不到后方可考虑停药，停药后也要定期随访。对于使用恩替卡韦治疗前已经诊断为乙肝肝硬化的患者，停药后乙肝病毒反弹可能发生肝衰竭，造成严重后果，因此，在恩替卡韦没有发生耐药的情况下，不建议随便停药。