在临床上出现肝门坠疼有可能是直肠肛管本身疾病所引起的，包括细菌感染性疾病，甚至肿瘤性疾病，也有可能是继发性的腹膜炎。如果是直肠肛管本身细菌感染性的，在形成脓肿时，需要及时行脓肿切开手术治疗，如果没有形成脓肿，通常采用抗感染治疗，一般使用头孢类的，通常使用二代或三代的头孢类的，革兰氏阳性球菌与革兰氏阴性杆菌，必要时需要配合抗厌氧菌的药物治疗。而如果是肿瘤性疾病，通常恶性肿瘤需要做肠癌根治，并配合术后的化疗，放疗，分子靶向药物治疗。除此以外，有可能是因为继发性的腹膜炎或者是原发性的腹膜炎，女性主要是原发性腹膜炎，男性通常主要见于阑尾穿孔或溃疡穿孔，所引起的继发性腹膜炎，通常需要行B超或CT检查以明确诊断，通常需要急诊手术治疗。