咳嗽导致肚子两侧疼痛是由于局部肌肉痉挛的原因造成的，咳嗽时会造成深吸气深呼气的现象，此时由于腹肌需要参与深呼吸的动作，会在频繁咳嗽时导致肌肉不能协调运动，出现痉挛拉伤岔气的现象，随后在咳嗽以及深呼吸时诱发疼痛。一般在咳嗽被控制后疼痛感自然消失，也可以局部热敷或涂抹扶他林乳膏治疗。