便秘可以是由一些器质性的病变引起，或者是一种功能性的便秘。以肠道疾病引起的便秘多见，可见于先天性巨结肠、炎症性肠病、外伤后期及肠吻合术后的狭窄，肿瘤及其转移所致肠狭窄、盆底失驰缓综合征、直肠内折叠、会阴下降、直肠前突、肛裂、痔疮、肠易激综合征等。或者是肠外的疾病引起，如脑梗死、脑萎缩、截瘫、抑郁症、厌食症、甲状腺功能低下、糖尿病、铅中毒、维生素B1缺乏、子宫内膜异位症等。或者是因为患者进食量减少、食物精细、食物热量过高、蔬菜水果少、饮水少、运动少、久坐、卧床或者有不良的排便习惯及人际关系紧张、家庭不和睦、心情长期处于压抑状态；或者是因生活规律改变，如外出旅游、住院、突发事件影响，都可导致排便规律改变而引起便秘。