妇科的衣原体感染比男性感染引起的症状要多一些，它的主要感染的部位是宫颈，由此垂直感染给新生儿，以至于发生盆腔炎，后遗症非常多，还会导致不孕症。女性感染衣原体不仅仅限于尿道，可以累积整个泌尿生殖道器官。这一类感染常常因为缺乏自觉症状或者是症状比较轻微，而忽视治疗，造成了传染源的扩散而形成很严重的危害。衣原体感染了缺乏症状，局部的病象便是诊断的重要指标，主要表现是阴道内有脓性的分泌物，也可以是粘液或者是浆液性的，分泌物当中含有较多的液体，而且还伴有臭味，阴道黏膜可以是正常的颜色，但是常常伴有宫颈糜烂。