慢性扁桃体炎多数是由急性扁桃体炎反复发作或者患者全身健康状况欠佳，加之扁桃体隐窝引流不畅，各类细菌、病毒滋生感染，演变成为扁桃体窝或扁桃体实质发生慢性炎症，是临床上常见的咽部疾病。某些传染病如猩红热、流感，麻疹等感染以后也可以并发慢性扁桃体炎。邻近病灶比如鼻腔鼻窦感染，可以伴发本病。本病的病原菌主要是甲型或者乙型溶血性链球菌、葡萄球菌等。