导致急性尿路感染常见的病原体有细菌如大肠杆菌，分枝杆菌，葡萄球菌，淋球菌等，其他的病原体还可能有支原体、衣原体、病毒，真菌等。以细菌感染最为常见，若由于客观条件的限制，未进行病原体的培养与药敏试验，一般采用喹诺酮类抗菌素进行治疗，常用药物有氧氟沙星，环丙沙星等。若能对急性尿路感染的患者进行尿液的病原体培养与药敏试验，选择药敏试验中敏感的抗生素进行抗感染治疗，则效果最佳。