临床中治疗尖锐湿疣的口服药物不是一线药物，例如转移因子、匹多莫德口服液等，这些药物是提高免疫力的辅助用药，单独应用效差，必须联合别的方法一起治疗。另外有研究口服伐昔洛韦颗粒，抗病毒治疗可能对治疗尖锐湿疣有一定的疗效，但也需要跟以下方法联合。尖锐湿疣主要的治疗方法有：物理治疗，如冷冻、激光、微波等。光动力治疗。外用药物治疗，如咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等。无论是哪种治疗，它的治疗原则是去除疣体，然后尽可能消除亚临床感染，防止复发。