肺结核可以通过痰涂片镜检和结核菌培养确诊，这是确诊肺结核最特异性的方法，抗酸染色镜检，快速简便，在我国非结核分枝杆菌尚属少数，抗酸杆菌阳性肺结核病诊断即可成立，直接厚涂片阳性率优于薄涂片，为目前普遍采用，规定观察300个视野方能报告阴性，除了痰标本外，脓液，病灶组织，显支镜刷检物，冲洗或灌洗液均可用于直接涂片检查，由于一些抗酸染色颗粒难以辨认，需要复检，集菌法涂片和应用金胺染色荧光境检阳性率高，早期鉴别生长菌需要进行菌培养，但不必等待菌落形成，报告时间较普通培养基缩短10天左右。