治疗肾结石的最好方法也就是最适合患者病情的治疗方法。当结石直径小于0.6厘米，表面光滑，结石以下尿路无梗阻，结石未引起尿路完全梗阻，特殊成分的结石对尿酸结石和胱氨酸结石，推荐采用内科治疗，增加液体摄入量，每日饮水2000到3000毫升，使尿量增加2到2.5升每天。改变饮食习惯，包括限制盐、蛋白质和草酸摄入，菠菜、红茶及巧克力等食物草酸含量高，应尽量减少摄入，高尿酸血症时要避免进食动物内脏、鱼、咖啡等。对于直径大于0.6厘米，小于2.0厘米结石，建议首选体外冲击波碎石术。对于结石大于2.0厘米或鹿角形结石，可采用经皮肾镜或输尿管镜取石术，对于少数复杂的肾结石可行开放性手术取石。