头皮毛囊炎最常见的是由细菌感染导致，需要使用抗菌的药物进行治疗，通常可以口服盐酸米诺环素胶囊，或者使用盐酸多西环素胶囊，也可以使用头孢地尼分散片，或者头孢克洛缓释片等进行治疗。同时可以配合外用的消炎的药膏，选择莫匹罗星软膏或者夫西地酸乳膏、红霉素软膏。还有情况是头皮毛囊炎考虑是由真菌感染导致，需要使用抗真菌的药物内服和外用治疗，外用抗真菌的药物，可以选择盐酸特比萘芬喷雾剂，或者使用克霉唑溶液等。同时要配合口服抗真菌的药物进行治疗，肝肾功能正常者可以选择伊曲康唑分散片等。