消化性溃疡的治疗目标为去除病因，控制症状，促进溃疡愈合，预防复发和避免并发症。其治疗包括药物治疗、内镜治疗及外科手术治疗。为了达到溃疡的愈合，抑酸药物的疗程通常为4~8周，胃溃疡的疗程为6~8周，其中根除幽门螺杆菌所需的1~2周疗程，可重叠在4~8周的抑酸药物疗程内，也可在抑酸疗程结束后进行。胃溃疡愈合后，大多数病人可以停药，但对于溃疡多次复发，在祛除常见诱因的同时，要进一步查找是否存在其他的病因，并给予维持治疗，即较长时间服用维持剂量的h2受体拮抗剂或质子泵抑制剂，疗程因人而异，短则3~6个月，长者1~2年，视具体病情延长用药时间。