精子畸形率高，最主要的原因是睾丸本身、精索静脉曲张或者后天的影响导致的畸形率高。睾丸如果受到外伤、高温或者其他一些损害，会容易产生精子畸形率高。精索静脉曲张静脉回流不畅，睾丸产生的废物不能顺利代谢出体内，容易出现畸形率高。日常生活的习惯不注意，比如高温、抽烟、喝酒、熬夜、泡热水澡、蒸桑拿，或者接触油漆、汽油、化学性及放射性的物质，也容易导致精子畸形率高。