肺部肉芽肿根据病因不同，治疗方法也不同，可分别给予抗结核、抗真菌以及糖皮质激素等治疗。肉芽肿性肺疾病是一组以肉芽肿性炎症和肉芽肿形成为共同病理特征的肺部疾病。常见的肉芽肿性疾病如下：（1）各种微生物感染所致肉芽肿：如结核、真菌（曲霉、隐球菌、组织胞浆菌、球孢子菌等）、寄生虫感染等，可给予抗结核、抗真菌、抗寄生虫治疗。（2）外源性过敏性肺泡炎、肉芽肿性多血管炎、嗜酸性肉芽肿性多血管炎、坏死性结节性肉芽肿病，可给予糖皮质激素治疗为主，或者用免疫抑制剂治疗。