清咽滴丸的副作用非常的罕见，当然从临床应用以及文献记载上可能会出现以下情况第一过敏反应，有些人在服用清咽滴丸以后会出现皮疹，皮肤发红，瘙痒这样的情况，甚至有的类似荨麻疹的改变，考虑可能是清咽滴丸引发的过敏反应。第二很少的患者有可能在服用清咽滴丸以后出现胃肠道方面的症状，有烧心，恶心症状表现，有可能是清咽滴丸导致的，尤其是本身就胃肠功能不好的患者有可能在服用以后产生局部刺激症状，出现上述反应。第三就是清咽滴丸有可能会引起肝肾功能的不好，导致肝功能一过性升高，也有可能会引发肾脏功能的不好，导致肌酐、尿素氮水平的升高，这个属于罕见的。