目前，偏头痛的发病机制尚不十分清楚，现在主要有以下的几种说法，一是血管的学说，这种学说认为偏头痛是原发性的血管疾病，是由血管舒缩功能障碍引起的；第二种学说是神经学说，认为是偏头痛由原发性神经功能紊乱性疾病引起；再就是三叉神经血管学说，这种学说近年来受到广泛的重视；再就是视网膜丘脑皮质机制学说，认为偏头痛是一种与感觉模式失调有关的疾病。