消化不良便秘可以吃促胃肠动力药，如多潘立酮、莫沙必利、依托必利等，还可以选择益生菌，如复方嗜酸杆菌、双歧杆菌、乳酸杆菌、酪酸菌等。这两类药物副作用少，可以长期服用，尤其是益生菌，可以坚持服三个月到半年，可以有效的改善肠道微生态，有效治疗便秘。如果上述两类药物效果不好，可以适当选择一些泻药，如硫酸镁、甘露醇乳果糖、大黄苏打片、番泻叶、蓖麻油、酚酞等。如果药物效果不好，可以选择灌肠导泻治疗。患者平时要注意多喝水，多吃蔬菜水果，多运动，并养成每天定时排便的习惯。