急性化脓性扁桃体炎最主要的治疗方法是抗生素的应用。抗生素首选青霉素类，根据病情的轻重决定给药途径。如果对青霉素类过敏，可以选择奎洛酮类，成人选择奎洛酮类抗生素，儿童可以选择阿奇霉素。如果用药2到3天后仍旧有持续的高热、咽痛，病情无明显的好转，应该分析原因。必要的时候改其他的抗生素或取扁桃体表面的分泌物培养，根据培养的结果选择敏感的抗生素治疗。扁桃体发炎是有传染性的，因此要适当的隔离。