多囊卵巢综合症病因上大致有两类，大部分多囊卵巢综合症比较肥胖，肥胖是多囊卵巢综合症的主要病因。肥胖女性皮下脂肪会转化生成大量的雄激素，雄激素会抑制卵泡发育，造成卵巢有多个小卵泡发育，但是没有优势卵泡形成，没有周期性的排卵，没有周期性的雌孕激素变化，也就没有周期性的来月经。表现为女性几个月来一次月经，甚至停经，常常伴有不孕。另一类多囊卵巢综合症没有明显肥胖，属于垂体分泌激素异常，垂体分泌LH黄体生成素相对过多，LH会诱导卵巢分泌较多雄激素，较多的雄激素同样也会抑制卵泡的发育，造成多囊卵巢综合症样表现。所以大部分多囊卵巢综合症与肥胖相关，一部分多囊卵巢综合症与垂体功能异常相关。