反流性食管炎常用的有抑制胃酸分泌的药物，常用的有质子泵抑制剂或者H2受体拮抗剂，常用的质子泵抑制剂有奥美拉唑、兰索拉唑、雷贝拉唑、泮托拉唑、艾普拉唑、艾司奥美拉唑等。H2受体阻滞剂有法莫替丁、雷尼替丁、西咪替丁等。还可给予促进胃肠动力的药物，如伊托必利、莫沙必利、多潘立酮等处理，但要和其他的药物至少间隔一小时以上服用。还可加用胃黏膜保护剂，如铝碳酸镁、马来酸伊索拉定、替普瑞酮、聚普瑞锌、吉法酯等处理。