导致小便酸痛的病因有很多，最常见的为感染性因素，比如前列腺炎、尿道炎、膀胱炎等，可通过前列腺液常规、尿常规、尿液培养等检查明确诊断，确诊以后应进行抗感染治疗。还可能为其他泌尿系统疾病引起，比如泌尿系统结石、肿瘤、前列腺增生等，应通过泌尿系统CT等检查明确诊断。