口腔溃疡同时发生牙根疼时，需要针对两种疾病进行不同的、相应的对症处理，具体如下：1、口腔溃疡的发生有其主要的诱发因素，并且发生口腔溃疡以后需要调节自己的作息以及饮食，避免熬夜、偏食，不要再进食辛辣、刺激，如麻辣香锅、火锅等上火的食物。在护理得当的情况下，口腔溃疡一般在两周左右可以愈合。2、如果发生口腔溃疡，同时存在牙根疼，需要对牙根的疼痛进行相应的诊断。如果牙根疼是牙齿发生了根尖周炎，这颗牙齿就需要进行根管治疗，根管治疗需要治疗3-4次，每次复诊的间隔为7-10天。总之，口腔溃疡和牙根疼实际上是两种独立的、不同的疾病，需要进行不同的对症处理。